農藥主要由三條途徑進入人體內：一是偶然大量接觸，如誤食；二是長期接觸一定量的農藥，如農藥廠的工人和使用者農民；三是日常生活接觸環境和食品中的殘留農藥，後者是大量人群遭受農藥污染的主要原因。環境中大量的殘留農藥可通過食物鏈經生物富集作用，最終進入人體。農藥對人體的危害主要表現為三種形式：急性中毒、慢性危害和“三致”危害。

  一、急性中毒

農藥經口、吸呼道或接觸而大量進入人體內，在短時間內表現出的急性病理反應為急性中毒。急性中毒往往造成大量個體死亡，成為最明顯的農藥危害。據世界衛生組織和聯合國環境署報告，全世界每年有100多萬人農藥中毒，其中2萬人死亡。美國每年發生6.7萬起農藥中毒事故，在發展中國家情況更為嚴重。我國每年農藥中毒事故達10萬人次，死亡約1萬多人。1995年9月24日中央電視臺報導，廣西賓陽縣一所學校的學生因食用噴灑過劇毒農藥的白菜，造成540人集體農藥中毒。

二、慢性危害

長期接觸或食用含有農藥的食品，可使農藥在體內不斷蓄積，對人體健康構成潛在威脅。有機氯農藥已被歐共體禁用30年，而聯邦德國一所大學對法蘭克福、慕尼黑等城市的262名兒童進行檢查，其中17名新生兒體內脂肪中含有聚氯聯苯，含量高達1.6毫克/千克脂肪。1975年美國研究機構從各州任意挑選出150所醫院，採集乳汁樣品1436份，經檢測大多數都含有狄氏劑、環氧七氯等。1983年我國哈爾濱市醫療部門對70名30歲以下的哺乳期婦女調查，發現她們的乳汁中都含有微量的六六六和DDT。農藥在人體內不斷積累，短時間內雖不會引起人體出現明顯急性中毒症狀，但可產生慢性危害，如：有機磷和氨基甲酸酯類農藥可抑制膽鹼酯酶活性，破壞神經系統的正常功能。美國科學家已研究表明，DDT能干擾人體內激素的平衡，影響男性生育力。在加拿大的因內特，由於食用殺蟲劑污染的魚類及獵物，致使兒童和嬰兒表現出免疫缺陷症，他們的耳膜炎和腦膜炎發病率是美國兒童的30倍。農藥慢性危害雖不能直接危及人體生命，但可降低人體免疫力，從而影響人體健康，致使其他疾病的患病率及死亡率上升。

三、致癌、致畸、致突變

國際癌症研究機構根據動物實驗確證，18種廣泛使用的農藥具有明顯的致癌性，還有16種顯示潛在的致癌危險性。據估計，美國與農藥有關的癌症患者數約佔全國癌症患者總數的10％。越戰期間，美軍在越南噴灑了大量植物脫葉劑，致使不少接觸過脫葉劑的美軍士兵和越南平民得了癌症、遺傳缺陷及其他疾病。據最近報導，越南因此已出現了5萬名畸形兒童。1989∼1990年，匈牙利西南部僅有456人的林雅村，在生下的15名活嬰中，竟有11名為先天性畸性，佔73.3％，其主要原因就是孕婦在妊娠期吃了經敵百蟲處理過的魚。目前我國頒布了5批農藥安全使用標準，規定10類農藥禁止在農業上使用。其中二溴氯丙烷可引發男性不育，對動物有致癌、致突變作用。三環錫、特普丹對動物有致畸作用。二溴乙烷可使人、畜致畸、致突變。殺蟲脒對人有潛在的致癌威脅，對動物有致癌作用。