4月29日，珠江綜合整治工作聯席會議辦公室通報了2006年度珠江綜合整治考核有關情況。據介紹，2006年珠江綜合整治工作成效明顯，主要大江大河水質維持Ⅱ∼Ⅲ類的良好水準，集中式飲用水源水質安全得到保障，污水處理廠建設步伐加快，但仍存在著工作進展不平衡，治理資金不足，污水處理費徵收標準普遍偏低等問題。

一年來，流域各市高度重視珠江綜合整治工作，取得明顯成效。一是主要大江大河水質維持良好（Ⅱ∼Ⅲ類），集中式飲用水源水質安全得到保障，大部分流經城市水體水質明顯改善。2006年珠江流域飲用水源水質達標率86.3%；省控斷面水質達標率75.3%，跨市河流交界斷面水質達標率85.7%，分別較2005年提高6.5和9.5個百分點。珠江廣州河段、東莞運河（城區段）水質進一步改善，水質優於Ⅴ類。珠江流域劣Ⅴ類水質的斷面比例從2002年的14.9%大幅下降至2006年的6.5%。二是污水處理廠建設步伐加快，城市污水處理率不斷提高。截至2006年底，流域共建成污水處理廠92座，處理能力679萬噸/日，比2005年增加20座，新增日污水處理能力91萬噸，流域城鎮生活污水處理率達到48.8%，比2005年增加3.4個百分點。所有設市城市已開徵污水處理費。三是工業污染防治不斷強化，工業廢水排放達標率達到92.2%，比上年提高0.5個百分點。四是畜禽養殖業整頓取得成效，有力打擊了禁養區養殖業回潮。五是河流兩岸生態、景觀整治成效突出。