水环境保护工作取得长足进展。省政府召开了广东省水污染防治会议，部署了我省跨世纪水环境保护任务；在汕头召开了现场办公会议，研究解决粤东水资源开发利用与水质保护问题。我省在水污染防治中，突出做好七方面工作: 一是全面推进《广东省碧水工程计划》实施。《广东省碧水工程计划》是我省一项跨世纪的宏伟工程，共115项，估计总投资200亿元。省政府于1997年下达，到2000年底，有105项在开展工作，完成了52项，累计投入资金67亿元;二是规范划定饮用水源保护区。全省21个地级以上市，完成了重点饮用水源保护区划定工作，为依法保护饮用水源提供了依据;三是依据省政府批准的《广东省地表水环境功能区》(试行方案)和《广东省近岸海域环境功能区》，对水环境实施分类管理;四是编制主要江河水质保护规划。已经批准实施江河水质保护规划有东江、韩江、九洲江、潭江等。已基本完成编制待报批江河水质保护规划有西江、北江、鉴江、漠阳江、榕江、练江等。经批准实施的规划，是科学管理流域水环境的依据与基础；五是对重点区域水污染进行整治。已批准实施的综合整治方案有淡水河、小东江、石马河(含观澜河)等，枫江综合整治方案已完成编制;六是推进城市污水处理工程建设。“九五”期间我省城市污水处理取得了较大进展，新增日污水处理能力 128万吨，全省城市污水处理设施日处理能力达183万吨;七是水质立法取得进展。继《广东省珠江三角洲水质保护条例》之后，《广东省韩江流域水质保护条例》、《广东省东江水系水质保护条例》起草修订工作进展顺利。 

    东深水质保护工作进一步加强。召开了东深水质保护工作会议；制定《关于进一步加强东深水质保护工作的通知》和《石马河流域水污染综合整治计划》。沿线深圳、东莞市各级政府和有关部门，根据东深水质工作有关要求，加强水质保护工作。推动生活污水处理，数十家千人以上企业生活污水得到了治理；严格控制养殖业发展，禁止零散养猪，全年共清拆生猪10万多头;做好流域垃圾处理与管理;做好水质恶化的应急处理，观澜河河道应急处理工程基本完成。